يعد مجلس الإدارة اعلي سلطه بالمعهد ويختص برسم السياسة العامة للمعهد وإقرار البرامج العلمية والتدريبية به ؛ ومتابعة إنجازات . ويرأس المجلس وزير الدولة للتنمية الاقتصادية ؛ ويضم في عضويته مدير المعهد ؛ ومديري المراكز العلمية بالمعهد ؛ ورئيس الجهاز المركزي للتعبئة العامة والإحصاء ؛ ووكيل أول وزارة الدولة للتنمية الاقتصادية؛ وخمسة أعضاء من ذوي الخبرة يختارهم رئيس المجلس .