يتولى مدير المعهد تصريف أمور المعهد وإدارة ؛ والإدارية ؛ والمالية ؛ ووضع خطط النشاط العلمي للمعهد في حدود قرارات مجلس الإدارة ؛ إلى جانب الإشراف على سير البحوث والدراسات وغيرها من الأنشطة العلمية الأخرى ؛ فضلا عن الأعمال الإدارية والمالية ؛ كما يفوض مدير المعهد في بعض سلطات مجلس الإدارة ورئيس المجلس بغرض تحسين أداء المعهد والبعد عن البيروقراطية ؛ كما له أن يشكل بعض اللجان العلمية والفنية التي تعاونه في أداء أعمال دون أن يتعارض نشاطها مع المراكز والإدارات الأخرى التي يتضمنها الإطار التنظيمي للمعهد . وتضم اللجان العلمية؛ والإدارات الفنية المعاونة له في أداء اختصاصاته
